经重庆市政府批准，由原重庆市第三人民医院、重庆市中山医院合并组建，于2016年3月25日挂牌成立。重庆市人民医院，2018年11月18日，依托医院成立了中国科学院大学重庆临床医学院中国科学院大学重庆医院(重庆市人民医院)是重庆市首批三级甲等综合性医院。2018年6月12日，在重庆市委市政府、市卫生健康委的支持下，与中国科学院大学签约共建中国科学院大学重庆医院（保留重庆市人民医院编制），成为中国科学院大学直属附属医院。
