按照“管办分离”的模式委托南方医科大学全面管理，南方医科大学深圳医院是新医改形式下，医院环境，按照“管办分离”的模式委托南方医科大学全面管理，由深圳市政府提供医院运营和可持续发展的政策与经费支持，医院动态。筹建历程，是深圳市政府实施医疗卫生“三名工程”和政校合作推进公立医院改革的重大项目，深圳医院，南方医科大学深圳医院，由深圳市政府按照三甲医院标准投资新建的一所公立医院。
文化传统/南方医科大学博学笃行，尚德济世
释义：
①博学：取自宋代张商英《素书》“博学切实，所以广知”。意为广博学识、丰富见闻、开阔胸襟、追求真理。广泛地猎取知识，保持对知识的好奇与渴望，这是完善自身、发展自我的客观要求。
②笃行：取自《礼记·中庸》“博学之，审问之，慎思之，明辩之，笃行之”。意为坚定信念、持之以恒、脚踏实地、身体力行。不空谈，不浮躁，确立目标，切实而坚定地行动，这是成就事业、实现理想的基本要求。
③尚德：取自《左传·襄公二十四章》“德，国家之基也”。意为诚信为本、德行为先、修身敬业、求真求善。培养纯正的品行，诚恳的态度，良好的修养，高尚的道德，这是教书育人、立身社会的根本要求。
④济世：取自《论语·雍也》“博施于民，而能济众”。意为尊重生命、拯救疾苦、乐于奉献、创新拓取。锤炼精湛的医术，树立服务人民、报效祖国的远大志向，这是传承医学、造就人才的较高要求。
校徽校徽整体呈盾牌形，由多元素巧妙组成，各设计元素内涵如下：
①皇冠：皇冠在西方文化中是*水平的象征，校徽顶端用皇冠意指要把学校建成国内一流、国际有影响的多科性医科大学的办学目标。
②麒麟：校徽上方两只奋力攀登的麒麟是中国传统文化中的瑞兽，象征祥瑞、繁荣与昌盛，同时也含有南方医科大学坐落于麒麟岗的寓意。
③木棉花：木棉花是广州市花，表达了南方医科大学地处广州这个国际大都市的地理优势，同时一朵盛放的木棉花，也象征了南方医科大学欣欣向荣的景象和持续发展的势头。
④双蛇杖：双蛇杖可作为医学事业的象征，表达了学校的办学性质是以医科为主的多科性医科大学。
⑤飘带：波浪状的飘带寓义南方医科大学人具有活跃的创造性思维和始终坚持改革开放的办学思路。
⑥橄榄枝与五星：两束相对的橄榄枝环抱在校徽两侧，既是军队的象征，也是人类健康、和平友好的象征。鲜红的五星表达出了建设一流医科大学的雄心。同时校徽通过橄榄枝与五星也表达了学校前身为中国人民解放军*军医大学的历史沿革，以及学校发扬军队优良传统，建设一流大学的决心。
⑦南方医科大学：学校中文全称（毛体），体现了办学指导思想。
⑧SOUTHERN MEDICAL UNIVERSITY：学校英文全称
⑨1951：表达了学校于1951年建校的办学历史
⑩盾牌：整个校徽为盾牌形，表达了学校甘作医疗卫士保卫人民生命与健康的理念。
校歌爱在南方
——南方医科大学校歌（歌词）
作词：陈道斌作曲：胡 平 绍 章
白云山下麒麟岗，
是我们神圣的殿堂。
勇攀医学高峰，
和谐春风伴随成长。
博学笃行 尚德济世，
生命责任在我们身上，
明理诚信，勤俭自强，
青春为理想闪光。
爱在南方，
情比珠江水长，
我们托起生命的希望。
白云山下麒麟岗，
是我们神圣的殿堂。
勇攀医学高峰，
和谐春风伴随成长。
博学笃行 尚德济世，
生命责任在我们身上，
明理诚信，勤俭自强，
青春为理想闪光。
爱在南方，
科学发展指引方向，
我们意气风发扬帆远航。
大学精神诚信务实，自强不息，敢为人先，追求卓越，
释义：
①“诚信务实”：代表了南方医大精神的内在品质，体现了南方医大人诚信为本、脚踏实地的理念。
②“自强不息”：代表了南方医大精神的刚性气质，表达了南方医大人百折不挠、勇往直前的气概。
③“敢为人先”：代表了南方医大精神的傲然风骨，表现出南方医大人解放思想、开拓创新的勇气。
④“追求卓越”：代表了南方医大精神的优秀品格，阐释了南方医大人永不满足、超越自我的气势。
学术研究/南方医科大学截至2014年6月，学校有4个国家重点实验室，国家中医药管理局三级科研实验室1个，2个省部共建重点实验室，12个广东省重点实验室，4个广东省教育厅重点实验室，校级研究所17个。
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改革成果“十五”以来，先后承担了包括国家“十五”、“十一五”教育科学规划项目和“世行贷款”项目在内的国家、军队和广东省教育研究课题93项。
在多科性医科大学办学模式、实验教学改革、创新教育、教学质量保障、教学管理信息化建设、医学教育技术研究、科研促进教学、医学人文教育等方面进行了深入探索和改革实践。获得省部级以上优秀教学成果奖49项，研制的《医学通用题库》，获得军队优秀教学成果二等奖，在全国50多家院校推广使用。
学校开发的教务管理软件《军队院校学籍管理系统》，被指定为全军和武警院校的教务管理系统。73项省部级二等奖以上科研成果（占“十五”以来总成果的58.87%）已经转化为教学资源直接服务本科教学；主编出版“十一五”规划等高水平教材11部，58项多媒体教材获省部级以上成果奖；建有6门国家精品课程、19门广东省精品课程、2个国家实验教学中心、9个广东省实验教学示范中心；建设了44门PBL课程、54门双语课程、33个本科生创新教育基地。
科学研究“十五”以来，先后承担各类课题2139项，获得纵向课题经费5.13亿元，主持“973”课题3项、国家自然科学基金重点项目12项；作为*完成单位获国家技术发明二等奖1项，国家科技进步二等奖7项，省部级科技成果一等奖24项。
2000年以来，我校有5项科研成果7次入选国家公布的年度科技十大新闻。
2004年~2008年，国家科技部公布的Medline 收录论文排名中，我校连续5年在全国1000余所高校中位居前16名；
2006年，侯凡凡教授的原创论文在国际*医学杂志《N Engl J Med》（《新英格兰医学杂志》）上发表，影响因子51.296，该成果被美国内科学年报评为“2006年内科学领域最重要的14项研究进展之一”。
学校特色根据国家科技部2004年底公布的发表论文全国高校排名中，学校位居第24位，在广东省高校中名列第2位；学校有5种期刊是国内本专业领域内的权威学术期刊，《学报》是广东省*一家同时被国际权威医学情报检索机构 IM 、CA 、AJ 同时收录的学术期刊，在全国92家医科大学学报类位列第二。
学校以项目为纽带建设了五大学科群：用于疾病诊断的生物新技术研究、重大疾病的分子基础及药物筛选、器官衰竭的防治研究、应对核化生恐怖的医学防护技术研究、疑难病证中西医结合诊疗方案优化及新制剂研发，2008年，该五大学科群被广东省评为广东省“211工程”第三期重点建设项目，获得建设经费逾亿元。
裴国献教授完成的“双前臂异体移植术”，是亚洲的第2例。
舒斯云教授发现了人脑内与学习记忆功能有关的新区域，被国际学术界命名为“舒氏区”。
尹炳生教授在世界上首先提出了符合参比系*性的头胸心电导联理论，被称为“尹氏导联”。
张汉承教授率先开辟了泪液学研究领域，创造了“泪液学”的英文单词，被誉为“泪液学”之父。
车小燕教授研制的SARS病毒抗原试剂盒，在发病首天就能从血液中检出SARS病毒，大大缩短了SARS的诊断时间。
学术资源馆藏资源
截至2013年11月，图书馆文献总量228.4万册，其中纸本书刊119.6万册， 电子图书105万余种，电子期刊3万8千余种，拥有 SCIE（科学引文索引）、Science、Nature、JAMA（美国医学会杂志）、NEJM（新英格兰医学杂志）、Lancet（柳叶刀），BMJ（英国医学杂志）等世界权威综合医学杂志、各医学学科外文核心期刊、电子图书、实验室指南、临床医师考试题库及手术视频、解剖图谱等数据库共85种；自建了南医院士文库、随书光盘库、南医博硕士论文库、南医专业课程电子教材库、学科资源网和SCI-E收录我校发表论文目录查询系统等， 形成了以生物医学文献为重点，涵盖文、史、哲、政、经、法、教育、管理等学科的馆藏资源体系。自建有南方医科大学学位论文数据库、随书光盘数据库和南医院士文库，形成了以生物医学文献为重点，外语、文学、计算机、军事、史地文献为特色，涵盖文、史、哲、政、经、法、教育、管理等学科的综合馆藏体系。
学术期刊
据2014年6月学校官网显示，学校有7个学报期刊，分别是：《南方医科大学学报》、《南方医学教育》、《护理学报》、《中国医学物理学》、《中华创伤骨科杂志》、《中华神经医学杂志》、《中国临床解剖学杂志》。
《南方医科大学学报》创刊于1981 年，月刊，为国内外发行 的高级综合性医药卫生期刊。已被美国Medline/PubMed、美国《化学文摘》(CA)、荷兰《医学文摘》（EMBASE）、中国科学引文数据库（CSCD）、中国科技论文统计源数据库、《中文核心期刊要目总览》（2011年版，北京大学图书馆）等国内外重要数据库收录。
