2007年以来，获得国家自然科学二等奖3项、国家科技进步二等奖1项、国家技术发明二等奖1项，获国家教学成果奖7项，国家级精品课35门，获中国青年科技奖1项，全国百篇优秀博士论文累计入选20篇。，2012年，被SSCI收录论文40篇，被CSSCI收录论文1478篇。南开大学既是教学中心，又是科研中心，取得了一批国内外公认的优秀科研成果。10项成果获2013年度天津市科学技术奖。南开官网，2013年，被SCI收录论文1399篇，被EI收录论文819篇，被CPCI-S收录会议论文79篇；“表现不俗”论文数628篇，占SCI收录论文总数的45.67%，所占比例居全国高校第二位。
南开大学有着广泛的国际影响，与国际知名的300多所大学和国际学术机构建立了合作与交流关系。承建了美国马里兰大学孔子学院等7所海外孔子学院，2012年获评“孔子学院先进中方合作院校”。学校承担了国家汉语对外教育培训任务，推出了牛津项目等一批水平较高的海外学习项目，参加了达沃斯全球大学领导者论坛，筹办了首届“天津论坛”，承担了国际公立大学联盟（IFPU）秘书处工作，首批入选国家汉办“新汉学国际研修计划”，与英国格拉斯哥大学联合设立南开大学—格拉斯哥大学联合研究生院，国际化水平不断提升。
诺贝尔奖获得者杨振宁、李政道、丁肇中、罗伯特?蒙代尔、彼得?杜赫提、卡尔?巴里?夏普莱斯、美国前国务卿基辛格、韩国前总统金大中，欧盟委员会前主席、意大利前总理罗马诺?普罗迪、法国现任外长（前总理）洛朗?法比尤斯、世界经济论坛主席克劳斯?施瓦布、著名作家金庸等被聘为名誉教授，一批海内外知名学者、著名政治家、企业家任客座教授、兼职教授。南开大学先后授予数学家陈省身、物理学家吴大猷、经济学家扬?米尔达尔、台湾海基会前董事长江丙坤、世界经济论坛主席克劳斯?施瓦布等9位国际著名人士名誉博士称号。
