中心现内设机构9个：党政办公室（纪检监察室）、财务资产处、临床与基础试题开发处、口腔与护理试题开发处、公卫与药学试题开发处、全科与医技试题开发处、考务管理处、研究评价处、信息技术处。国家医学考试网，国家医学考试中心是国内最早建立的全国性专业考试机构之一，是经中央编办批准成立的国家卫生健康委员会直属事业单位。
成立于1985年，由国家医学考试中心主办。国家医学考试网是国家卫生部直属卫生行业各类全国性考试的技术服务专门机构，国家医学考试网官网提供考生报名/缴费/准考证/成绩单等考生服务、资格审查/考场编排/信息管理等考务管理服务和考试用书指导等。
