上海财经大学还是经教育部和香港特区政府批准，第一所在香港设立研究生教学点的内地大学。上海财经大学研究生院，上海财经大学是全国首批获得博士学位授予权的高校之一，也是首批设立社会科学（经济学）博士后流动站的高校之一。截止2019年6月，学校拥有研究生导师2072名（含兼职），其中博士生导师409名（含兼职、平台），硕士生导师1663名（含兼职）。
学校拥有国家级重点学科4个（含1个培育），4个财政部重点学科，6个上海市重点学科；学校目前拥有哲学、理论经济学、应用经济学、法学、马克思主义理论、统计学、工商管理、管理科学与工程、公共管理9个一级学科博士点，54个二级学科博士点。哲学、理论经济学、应用经济学、法学、社会学、马克思主义理论、中国语言文学、外国语言文学、新闻传播学、数学、统计学、软件工程、管理科学与工程、工商管理、公共管理等15个一级学科硕士点，102个二级学科硕士点（含13个硕士专业学位）。
上海财经大学于1979年被批准开始招收硕士研究生，1981年被批准为全国首批具有授予博士学位的单位之一。，现有在校研究生6843人，其中博士生1183人。上海财经大学研究生院致力于培养具有国际竞争力的财经领域和其他社会领域的业界领袖，为世界文明与中国进步做出贡献。
