公司在创新药早期孵化、临床研究平台建设、中药创新及二次开发等方面开展高水平创新合作，对接多方优势资源，与多家高校、医院及科研院所在新药物发现、新作用机制、新疗法开发等多个方面的合作相继落实推进。
上海医药倡导“创新、诚信、合作、包容、责任”的企业核心价值观，致力于持之以恒，提升民众的健康生活品质，努力打造成为受人尊敬、具有行业美誉度的品牌药制造商和健康领域服务商。
公司创新药管线已有25个产品，其中15个产品进入临床或已上市。上海医药集团，2020年，公司创新药管线取得较多阶段性进展，I001用于治疗原发性高血压的有效性和安全性临床Ⅱ期试验已完成，临床Ⅲ期方案已获CDE同意,启动临床Ⅲ期试验；创新项目的国际化注册取得重大突破，I001-B获得FDA临床试验资格，启动溃疡性结肠炎临床Ⅱ期试验，拓展了该项目的新适应症；与俄罗斯BIOCAD合作的全人抗 PD-1 单抗“Prolgolimab 注射液”获得《临床试验通知书》，启动临床III期试验。
