国家临床重点专科项目18个(麻醉科、重症医学科、消化内科、临床护理、检验科、骨科、心血管内科、内分泌科、血液内科、儿内科消化专业、肾脏内科、神经内科、呼吸内科、急诊科、皮肤科、普通外科、烧伤科、中医科)，上海市优势学科2个，医院共设有42个临床科室、8个医技科室;现有国家教育部重点学科4个(血液病学、内分泌与代谢病学、心血管病学、神经病学)，上海市重点学科“重中之重”1个，上海市特色学科1个，上海市重点学科2个，上海市教委及卫生局重点学科6个。广慈医院，医院还设有上海市临床医学中心3个(微创外科、内分泌与代谢病、血液病)，市级研究所3个(上海市伤骨科研究所、上海市高血压研究所、上海市内分泌研究所)，院级研究所3个(上海烧伤研究所、上海血液学研究所、上海消化外科研究所)。此外，还建立了科技部国家重点实验室1个(医学基因组学重点实验室)和教育部重点实验室1个(功能基因组学和人类疾病相关基因研究重点实验室)，2个卫生部重点实验室(人类基因组研究重点实验室、内分泌代谢重点实验室)，5个上海市重点实验室等。
努力降低平均住院天数，加快床位周转速度，控制药占比，控制院内感染和提高医疗安全。医院还始终把健康教育作为一项重要责任，门诊“专家周周讲”吸引了大量病患及市民前来听讲，高血压健康教育中心已成为覆盖长三角地区的高血压教育培训基地。瑞金医院，此外控烟、糖尿病中心、烧伤的防治与急救、血液病肾脏病健康教育、乳腺病资源中心等都已经广泛开展，医务人员通过义诊、网络教育、上媒体讲座、下社区宣教等方式普及健康教育，大大提高市民防病的意识和能力。 近年来，医院积极推行数字化医疗流程管理，大力推广专病门诊、预约门诊、先诊疗后结算和日间病房等便民惠民措施，通过加强精细化管理手段，
并获得全国五一劳动奖状、全国卫生系统先进集体、全国模范职工之家、全国三八红旗集体、全国文明巾帼岗、全国青年文明号、上海市文明单位等诸多荣誉。追求卓越”的精神，连续三次获全国文明单位称号，医院秉持“广博慈爱，全面倡导“以优质的医疗使病人放心、以一流的服务使病人称心、以优美的环境使病人舒心”的服务理念，
